Tenk deg å våkne til en verden hvor hvert eneste menneske på mystisk vis har blitt forvandlet til stein...
En skjebnesvanger dag ble hele menneskeheten til stein. Mange årtusener senere frigjør Taiju seg fra forsteiningen og befinner seg omgitt av statuer. Situasjonen ser dyster ut – helt til han støter på sin vitenskapselskende venn Senku! Sammen planlegger de å starte sivilisasjonen på nytt med vitenskapens kraft!
Senku og Dr. Xeno er Stone Worlds topp to vitenskapsmenn, og nå slår de seg sammen for å lete etter opprinnelsen til petri-strålen som ranet hele menneskeheten. Men veien dit det hele startet viser seg å være en humpete en! Kan mannskapet krysse naturen for å komme seg dypt inn i Sør-Amerika, mens de unnslipper den voldsomt utholdende Stanley?