Tenk deg å våkne til en verden hvor hvert eneste menneske på mystisk vis har blitt forvandlet til stein...
En skjebnesvanger dag ble hele menneskeheten til stein. Mange årtusener senere frigjør Taiju seg fra forsteiningen og befinner seg omgitt av statuer. Situasjonen ser dyster ut – helt til han støter på sin vitenskapselskende venn Senku! Sammen planlegger de å starte sivilisasjonen på nytt med vitenskapens kraft!
Ved ankomst til Kohakus landsby planlegger Senku å gjøre allierte ut av landsbyboerne. Først ut er Chrome, som Senku vinner over etter å ha slått ham i en vitenskapelig kamp. Deres første store oppgave? Å lage et universalmiddel for å kurere Kohakus eldre søster, Ruri.