Rubys far Norman er den nye treningslederen i Petalburg City. Men Ruby vil ikke følge i farens fotspor - han vil vinne Pokémon-konkurranser! Sapphires far professor Birch er den lokale Pokémon-forskeren. Men Sapphire er lei av å samle vitenskapelige data – hun vil vinne Pokémon Battles! Når Ruby og Sapphire møtes, er det mer sannsynlig at de slår hverandre enn å slå den. Men så utfordrer Sapphire Ruby til en konkurranse! Hvem av dem vil oppnå drømmene sine på bare åtti dager?!