Med sine røde øyne og uhyggelige evne til å forutsi været, har Shiki alltid vært det rare barnet i landsbyen hans. Til tross for sine særheter, er han verdsatt av landsbyhøvdingens heftige sønn, Yamato, og de vokser opp sammen som de kjæreste vennene. Men når sjamanessen Himiko, hersker over Yamatai, velger Shiki som et rituelt offer, blir de to revet fra hverandre. Yamato bruker år på å søke forgjeves håp etter tegn på Shiki, bare for å finne ham i live og frisk... i sentrum av Himikos hoff?
Forkledd som sjamanen og arvingen av hennes guddommelige kraft, er Shiki ikke lenger menneskelig og kan ikke lenger handle etter menneskelige ønsker. Til tross for det er Yamato ivrig etter å sverge seg selv til "hennes" tjeneste og stå ved sjamanenes side for å beskytte og lede folket deres. Men kan Shiki motstå sin kjærlighet til Yamato, selv om det betyr å gå mot gudenes vilje...?