Commission of Counter Ghoul er den eneste organisasjonen som kjemper mot Ghoul-trusselen, og de vil bruke alle verktøyene de har til rådighet for å beskytte menneskeheten mot dens ultimate rovdyr.
Deres nyeste våpen i denne skjulte krigen er en eksperimentell prosedyre som implanterer menneskelige etterforskere med en Ghoul's Kagune, og gir dem Ghoul-krefter og -evner. Men både prosedyren og den nyopprettede Qs Squad er uprøvd. Vil de bli helter ... eller monstre?!
Haise Sasaki har fått i oppgave å lære Qs Squad hvordan de skal være fremragende etterforskere, men oppdraget hans er komplisert av de plagsomme personlighetene til hans underordnede og hans eget usikre grep om hans Ghoul-krefter.
Kan han trekke denne tøffe gruppen sammen som et lag, eller vil Qs Squads første oppdrag være deres siste?